Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc3Q8CHP6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc3Q8CHP6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms