Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc43a2Q8CGA3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms