Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klf17Q8CFA7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms