Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms