Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vcpip1Q8CDG3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms