Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030452D12RikQ8CD33 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030452D12RikQ8CD33 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms