Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc5Q8CAL5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc5Q8CAL5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms