Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4bp3Q8C7U1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
N4bp3Q8C7U1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms