Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C3W1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C3W1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C3W1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C3W1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C3W1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C3W1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q8C3W1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms