Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3D3

Gm5468, Predicted gene 5468, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5468Q8C3D3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5468Q8C3D3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5468Q8C3D3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5468Q8C3D3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5468Q8C3D3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5468Q8C3D3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5468Q8C3D3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5468Q8C3D3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5468Q8C3D3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms