Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X0

Lca5l, Lebercilin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5lQ8C0X0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lca5lQ8C0X0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lca5lQ8C0X0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5lQ8C0X0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lca5lQ8C0X0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms