Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim47Q8C0E3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim47Q8C0E3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms