Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser1Q8C0C4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccser1Q8C0C4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccser1Q8C0C4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms