Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc12Q8BW49 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttc12Q8BW49 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms