Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr9Q8BV84 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms