Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pggt1bQ8BUY9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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