Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rccd1Q8BTU7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rccd1Q8BTU7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300.6 ms