Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6kb1Q8BSK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6kb1Q8BSK8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms