Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abraxas1Q8BPZ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas1Q8BPZ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms