Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf1Q8BNE1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Tcaf1Q8BNE1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Tcaf1Q8BNE1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Tcaf1Q8BNE1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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Tcaf1Q8BNE1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Tcaf1Q8BNE1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcaf1Q8BNE1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf1Q8BNE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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