Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gga3Q8BMI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gga3Q8BMI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms