Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zcchc4Q8BKW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms