Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gcfc2Q8BKT3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms