Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vipas39Q8BGQ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vipas39Q8BGQ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Vipas39Q8BGQ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms