Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a9Q8BGD6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc38a9Q8BGD6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a9Q8BGD6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms