Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pknox2Q8BG99 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox2Q8BG99 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms