Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Katnb1Q8BG40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Katnb1Q8BG40 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms