Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChfrQ810L3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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