Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT3

Cct8l1, Chaperonin-containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8l1Q80YT3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cct8l1Q80YT3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cct8l1Q80YT3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cct8l1Q80YT3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms