Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna12Q80SS5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna12Q80SS5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms