Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rexo1Q7TT28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo1Q7TT28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo1Q7TT28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms