Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg1bQ7TSF1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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