Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb2aQ7TMM9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb2aQ7TMM9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb2aQ7TMM9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb2aQ7TMM9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb2aQ7TMM9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb2aQ7TMM9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb2aQ7TMM9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb2aQ7TMM9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubb2aQ7TMM9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb2aQ7TMM9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms