Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vma21Q78T54 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vma21Q78T54 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms