Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms