Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igsf3Q6ZQA6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igsf3Q6ZQA6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igsf3Q6ZQA6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms