Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf653Q6YND2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf653Q6YND2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf653Q6YND2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.4 ms