Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc44a1Q6X893 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc44a1Q6X893 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc44a1Q6X893 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms