Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npc1l1Q6T3U4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npc1l1Q6T3U4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Npc1l1Q6T3U4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npc1l1Q6T3U4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npc1l1Q6T3U4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npc1l1Q6T3U4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms