Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc154Q6RUT8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc154Q6RUT8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms