Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab35Q6PHN9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab35Q6PHN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms