Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig3Q6P1C6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms