Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Soga3Q6NZL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms