Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RragbQ6NTA4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RragbQ6NTA4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RragbQ6NTA4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms