Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp140Q6NSQ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp140Q6NSQ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms