Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9bQ6EBV9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg9bQ6EBV9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg9bQ6EBV9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms