Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q66JV7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q66JV7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q66JV7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q66JV7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q66JV7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q66JV7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q66JV7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q66JV7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q66JV7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q66JV7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q66JV7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q66JV7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q66JV7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q66JV7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q66JV7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q66JV7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q66JV7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q66JV7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q66JV7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q66JV7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q66JV7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q66JV7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q66JV7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q66JV7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q66JV7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q66JV7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q66JV7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q66JV7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q66JV7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q66JV7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q66JV7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q66JV7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q66JV7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q66JV7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q66JV7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q66JV7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q66JV7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q66JV7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q66JV7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q66JV7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q66JV7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q66JV7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q66JV7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q66JV7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q66JV7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q66JV7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q66JV7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q66JV7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q66JV7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q66JV7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q66JV7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q66JV7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q66JV7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms