Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gja3Q64448 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gja3Q64448 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms