Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clcn1Q64347 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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Clcn1Q64347 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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Clcn1Q64347 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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Clcn1Q64347 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clcn1Q64347 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clcn1Q64347 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
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Clcn1Q64347 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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Clcn1Q64347 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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Clcn1Q64347 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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Clcn1Q64347 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clcn1Q64347 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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Clcn1Q64347 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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Clcn1Q64347 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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Clcn1Q64347 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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Clcn1Q64347 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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Clcn1Q64347 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
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Clcn1Q64347 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
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