Protein–RNA interactions for Protein: Q641K1

Agtpbp1, Cytosolic carboxypeptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agtpbp1Q641K1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Agtpbp1Q641K1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Agtpbp1Q641K1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Agtpbp1Q641K1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Agtpbp1Q641K1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms